Voor het beoordelen of een omgevingsvergunning kan worden verleend voor een project gelegen in de grensregio met Vlaanderen moet het bevoegde gezag in Nederland ook kijken naar mogelijke effecten van stikstofdepositie op Vlaamse Natura 2000-gebieden. Dit geldt andersom ook voor het bevoegde gezag in Vlaanderen voor stikstofeffecten van Vlaamse projecten op Nederlandse Natura 2000-gebieden.
Het afgelopen jaar zijn met de betrokken grensprovincies afspraken gemaakt over de toetsing van deze projecten en over de manier waarop deze door bevoegde gezagen gedeeld worden voor advisering en inspraak met autoriteiten aan de andere kant van de grens. Belangrijk uitgangspunt is dat sprake is van gelijkwaardigheid en wederkerigheid. Eventuele vragen kunnen worden gesteld aan de Helpdesk van BIJ12.